Новейшие данные геномной эпидемиологии, опубликованные исследователями Оксфордского института Ineos, переосмысливают роль интенсивного птицеводства в распространении инфекций. Секвенирование и сравнительный анализ почти трех тысяч штаммов Campylobacter позволили количественно оценить давление отбора, оказываемое агропромышленными экосистемами. Установлено, что промышленные фермы действуют не только как пассивные накопители возбудителя, но и как активные катализаторы его микроэволюции.
По данным мониторинга, в большинстве развитых стран этот патоген удерживает пальму первенства среди бактериальных агентов пищевых токсикоинфекций. На птицефабриках происходит направленная селекция признаков, способствующих колонизации кишечника сельскохозяйственной птицы, а также на накопление генов устойчивости к терапевтическим концентрациям антибиотиков.
Итоги вычислительного моделирования продемонстрировали феномен «абсорбции» генетического разнообразия, при котором крупные хозяйства всасывают широкий спектр аллельных вариантов из внешних резервуаров, формируя устойчивые эпидемические линии. Ретроспективное исследование, охватившее население Оксфордшира, выявило корреляцию на уровне 80% между рационом, содержащим мясо птицы, и риском инфицирования.